Tesla podľa uniknutého softvéru plánuje priniesť do Modelu Y kvalitnejší HEPA filter, ktorý je prítomný v modeloch X a S. Tento filter by mal podľa tvrdení spoločnosti v pri najvyššom výkone ochrániť posádku aj pred biologickými zbraňami, z čoho vychádza aj názov špeciálneho režimu klimatizácie „Bioweapon Defense Mode“.